水处理站运行初期，由于来水COD总量远小于设计处理能力，为保证好氧污泥活性，污水经过酸化池预处理后直接进入推流式曝气池内进行好氧处理，为刚接种的好氧污泥提供较好的生长环境。同时根据二沉池出水水质调整Fenton系统加药量以保证最终出水水质满足排放要求。由于利用当地同类型污水处理站内较新鲜的活性污泥进行接种并提供了充分的营养源，好氧污泥驯化过程较顺利。
待纸厂来水水质及水量稳定后，开始将污水导入厌氧反应器内开始厌氧处理段调试。厌氧反应器调试初期出水中死泥较多并导致推流式曝气池起始段有明显恶臭。现场将部分污水直接进入好氧处理段以降低厌氧反应器的处理负荷，待厌氧反应器出水稳定后再逐步提高进水量。该措施效果明显，厌氧污泥活性恢复良好。
